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Reference Genes for the Normalization of Gene Expression in Osteosarcoma Cell Lines

Laufzeit: 01.01.2012 - 31.12.2014

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Kurzfassung


Referenzgene, oder Housekeeping-Gene (HKG) spielen eine Rolle bei der Normalisierung von mRNA-Expressionsanalysen. Molekulare Marker, welche eine frühe Diagnose erlauben sowie die Metastasierung zu einem frühen Zeitpunkt anzeigen sind Gegenstand intensiver Forschung. Ein wichtiges Instrument der Genexpressionsanalyse ist die Polymerase-Kettenreaktion (PCR). Sie bedingt die Verwendung von Referenzgenen, um die experimentelle Variablität zu kontrollieren. Jedoch setzt dies eine vorangegangene...Referenzgene, oder Housekeeping-Gene (HKG) spielen eine Rolle bei der Normalisierung von mRNA-Expressionsanalysen. Molekulare Marker, welche eine frühe Diagnose erlauben sowie die Metastasierung zu einem frühen Zeitpunkt anzeigen sind Gegenstand intensiver Forschung. Ein wichtiges Instrument der Genexpressionsanalyse ist die Polymerase-Kettenreaktion (PCR). Sie bedingt die Verwendung von Referenzgenen, um die experimentelle Variablität zu kontrollieren. Jedoch setzt dies eine vorangegangene Validierung dieser Gene voraus. Dies wurde bei Osteosarkomzellen bislang noch nicht durchgeführt. Referenzgene kodieren zumeist für Enzyme metabolischer Kernprozesse wie beispielsweise Glycolyse (ALDOA, GAPDH), Purinstoffwechsel (HPRT), Proteinfaltung (PPIA, PPIB), Transkriptionsfraktoren (TBP), zytoskeletale Proteine (ACTB, TUBB) oder Zelloberflächenproteine (B2M). Somit besteht Grund zu der Annahme, dass diese Gene bei Osteosarkomentwicklung und –metastasierung reguliert sein könnten, was den Erfordernissen eines Referenzgenes entgegen stehen würde. Wir analysierten die Expression von 9 häufig verwendeten Referenzgenen mit Hilfe von quantitativer real-time PCR in etablierten Osteosarkom-Zellinien und bei Osteoblasten. Weiterhin ist geplant, diese Untersuchungen in Zellen aus Tumor-Biopsien von Patienten, welche an einem Osteosarkom leiden, zu untersuchen.

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