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Bioinformatic analysis of fully sequenced proteomes

Laufzeit: 01.01.2007 - 31.12.2015

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Kurzfassung


Die massive Sequenzierung vollständiger Genome in den letzten Jahren hat zu einer Fülle an molekularen Daten über alle Arten des Lebens geführt. Gegenwärtig sind von über 700 Bakterien, 40 Archaeen, 120 Eukaryonten sowie etwa 1000 eukaryontischen Organellen Komplettsequenzen verfügbar. Die funktionelle und vergleichende Interpretation dieser Daten steht jedoch bislang noch in keinem Verhältnis zur akkumulierten Datenmenge. Durch komparatistische Ansätze auf Proteinebene versuchen wir, aus den...Die massive Sequenzierung vollständiger Genome in den letzten Jahren hat zu einer Fülle an molekularen Daten über alle Arten des Lebens geführt. Gegenwärtig sind von über 700 Bakterien, 40 Archaeen, 120 Eukaryonten sowie etwa 1000 eukaryontischen Organellen Komplettsequenzen verfügbar. Die funktionelle und vergleichende Interpretation dieser Daten steht jedoch bislang noch in keinem Verhältnis zur akkumulierten Datenmenge. Durch komparatistische Ansätze auf Proteinebene versuchen wir, aus den bekannten nukleären und organellären Genomsequenzen generelle Aussagen über die Evolution des Lebens abzuleiten. Unser besonders Interesse gilt hierbei der Evolution des genetischen Codes, der Entstehung der Aminosäuren und der aus ihnen abgeleiteten Coenzyme sowie der Rolle, die molekularer Sauerstoff bei diesen Prozessen gespielt hat. Wir mutmaßen, daß sich in vollständigen Genomsequenzen evolutionäre Adaptationen auf generelle biochemische Mechanismen widerspiegeln, welche auch heute noch wirksam sind und die im Menschen ursächlich für degenerative Krankheiten und den Alterungsprozeß sein könnten.» weiterlesen» einklappen

Beteiligte Einrichtungen