In silico Verfahren zur Identifizierung und molekularen Charakterisierung von Tumorantigenen der Cancer/Germline Klasse
Laufzeit: 01.01.2003 - 31.12.2009
Kurzfassung
Die Identifikation von tumorspezifisch exprimierten Genprodukten ist die Grundlage für spezifische diagnostische und therapeutische Ansätze. Eine besondere Stellung unter diesen tumorspezifischen Genprodukten nimmt die Klasse der Cancer/Germline(CG)-Gene ein, die in verschiedenen Tumorentitäten in unterschiedlichen Frequenzen exprimiert werden. Eine Expression findet sich nicht in Normalgeweben mit der Ausnahme von Keimzellen. Einige CG-Gene werden bereits in immuntherapeutischen Studien als...Die Identifikation von tumorspezifisch exprimierten Genprodukten ist die Grundlage für spezifische diagnostische und therapeutische Ansätze. Eine besondere Stellung unter diesen tumorspezifischen Genprodukten nimmt die Klasse der Cancer/Germline(CG)-Gene ein, die in verschiedenen Tumorentitäten in unterschiedlichen Frequenzen exprimiert werden. Eine Expression findet sich nicht in Normalgeweben mit der Ausnahme von Keimzellen. Einige CG-Gene werden bereits in immuntherapeutischen Studien als Tumorvakzine erprobt. Der Grossteil der bekannten CG Gene wurde durch CTL- respektive Antikörper-basierte Methoden identifiziert. Dass es sich bei den CG-Genen um primär keimzell-spezifische Genprodukte handelt, die aberrant in Tumorzellen exprimiert werden, haben wir für die Konzeption eines genomweiten data mining Ansatzes zur Identifizierung neuer CT-Antigene genutzt. Die Anwendung dieses systematischen virtuellen Klonierungskonzeptes unter Nutzung öffentlich zugänglicher Gen- und Expressionsdatenbanken und der vorhandenen bioinformatischen Ressourcen und Tools führte bereits zu Identifizierung neuer Mitglieder dieser Genklasse. Dieses Projekt verfolgt den Ausbau dieser erfolgreichen Klonierungsstrategie zur Identifizierung weiterer tumorspezifischer Genprodukte. Des Weiteren sollen Analysen zur funktionellen und immunologischen Charakterisierung der bereits identifizierten CG-Gene ihre tumorätiopathogenetische Relevanz sowie die diagnostische und therapeutische Nutzbarkeit eruieren.» weiterlesen» einklappen
Veröffentlichungen
- Helftenbein, G; Koslowski, M; Dhaene, K et al.
- In silico strategy for detection of target candidates for antibody therapy of solid tumors.
- Wu, J; Helftenbein, G; Koslowski, M et al.
- Identification of new claudin family members by a novel PSI-BLAST based approach with enhanced specificity.
- Koslowski, M; Sahin, U; Huber, C et al.
- The human X chromosome is enriched for germline genes expressed in premeiotic germ cells of both sexes.